葡萄胎的水泡样组织已超过子宫腔的范围，侵入到子宫肌层，或者转移到其它部位，其性质已和恶性肿瘤一样，具有较大的破坏性，故称为恶性葡萄胎。
恶性葡萄胎绝大部分来源于良性葡萄胎。由良性转为恶性的时间不一，偶有在葡萄胎排出前已侵入子宫肌层或出现肺及阴道转移，但多数在葡萄胎排出后相隔几周或几个月，才转变为恶性葡萄胎。
临床上表现为：
(1)葡萄胎清宫术后持续不规则阴道流血，或月经恢复正常数月后又开始流血。
(2)病灶穿出子宫浆膜层时可引起局部疼痛及压痛，有的甚至可引起内出血。
(3)病变如转移到肺、阴道、脑、脊髓等处，可相应出现咯血、阴道蓝色结节、剧烈头痛、呕吐等症状。
典型的恶性葡萄胎的诊断根据：
(1)有葡萄胎史。
(2)临床出现上述症状。
(3)胸片肺内有小圆形影或阴道出现蓝色结节。
(4)再结合血尿中HCG测定、刮宫、子宫碘油造影等方法来确诊。